Por sorprendente que pueda parecer, esto es algo bastante frecuente. Aunque a ninguno nos gustaría estar dentro del avión en ese momento, es muy improbable que el impacto del rayo afecte a la seguridad del vuelo.

El avión es inmune porque es una Jaula de Faraday, ¿una queeé…?
La Wikipedia nos dice lo que es una Jaula de Faraday:
Se conoce como jaula de Faraday al efecto por el cual el campo electromagnético en el interior de un conductor en equilibrio es nulo, anulando el efecto de los campos externos.
O dicho de forma más sencilla: una jaula de Faraday es una caja metálica que protege de los campos eléctricos estáticos y que impide que estos pasen a su interior. En el caso de los aviones esta caja metálica es todo su carenado, o sea, su capa exterior metálica.
Una revisión y a volar
Aunque la caída del rayo en el avión no afecta a la seguridad del vuelo, sí que suele causar algunos daños no críticos que se reparan en tierra. El meteoradar y algunos remaches del fuselaje son los componentes que con más frecuencia se ven afectados.